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從基因模塊到合成生物,創(chuàng)造“自然”的迷人和危險

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從基因模塊到合成生物,創(chuàng)造“自然”的迷人和危險

把拼接大自然的“原始積木”拆開,然后以更適合人們需要的方式重新搭建起來的合成生物技術(shù),既迷人,又危險。

文|觀察未來科技

過去,人們一直在想象著怎樣改善社會和環(huán)境,現(xiàn)在,在合成生物學(xué)的支持下,人們正在實現(xiàn)這些夢想。合成生物學(xué)是一項關(guān)于創(chuàng)造自然的神奇技術(shù)——人們需要先把拼接大自然的“原始積木”拆開,然后以更適合人們需要的方式重新搭建起來。制造生物燃料、幫助改善干細胞生物學(xué),這些都是合成生物學(xué)。

如今,人們已經(jīng)可以用酸奶肅清霍亂,可以生產(chǎn)酵母來給汽車提供動力,還可以改變微生物基因來清理環(huán)境。在未來,人們甚至還能用現(xiàn)有的生物實現(xiàn)電子工程干的事情——生物計算機將與普通計算機一樣實現(xiàn)邏輯門運算,這無疑為生物學(xué)開辟了新的道路。

從基因模塊到合成生物

合成生物學(xué)是一個新興領(lǐng)域,它主要是運用工程技術(shù)來設(shè)計和構(gòu)建新的生物部件、設(shè)備和系統(tǒng),以實現(xiàn)自然界中不存在的新穎功能或生命形式。合成生物學(xué)依賴基因工程、生物工程、系統(tǒng)生物學(xué)和許多其他工程學(xué)科,并且需要使用這些學(xué)科所提供的工具。

實際上,人們很早就已經(jīng)在嘗試改造“生物”以創(chuàng)新自然。早在12000年前農(nóng)業(yè)開始出現(xiàn)的時候,人們就一直用馴化馴養(yǎng),進而用育種和人工選擇的方法改良動植物。人類誘捕酵母和細菌來制作啤酒、葡萄酒和奶酪;馴服動物,使動物能夠成為人類最好的朋友;人們還巧妙地把草原變成食物來源。

人們改造“生物”的進一步發(fā)展,就誕生了合成生物學(xué)這門技術(shù)。合成生物學(xué)的誕生,還離不開一個重要的背景,就是人類對于基因的認(rèn)識。

我們可以將基因看作是大自然的原始碼。幾十年前,人類逐漸學(xué)會了能又快又精準(zhǔn)地萃取基因、描述其特性,并開始思索如何將基因植回生物體內(nèi)——有時植人相同物種,有時植入完全不同的物種。研究人員可能會保持基因完好,以觀察其表現(xiàn);或是予以修改,甚至蓄意破壞,來觀察這些部分受損的基因會發(fā)生什么事,并基于此來測試不同基因的作用。這就是所謂的基因工程。

基因工程技術(shù)之所以能成真,在于所有生物的基本組成單位都是一樣的。地球上所有生物都由四個“字母”排列組合而成,這些字母組成有意義的DNA,編寫出基因,再轉(zhuǎn)譯成22種胺基酸;這些胺基酸互相鏈結(jié),形成了蛋白質(zhì)——蛋白質(zhì)則是構(gòu)成生命體的主要成分。

在基因工程的背景下,一個“即插即用”的方法正在被開發(fā)出來,以便于分子水平上的操作,那就是合成生物技術(shù)。通過合成生物學(xué),人類得以建立了一套系統(tǒng),截取這些經(jīng)過千萬年演化的基因并進行重新組合。

合成生物學(xué)有多種類型。一些研究者不僅為特定目的而重新編寫基因碼,更以這些“字母”重新編寫出自然界沒有的DNA“語言”。另一些科學(xué)家則著眼于將DNA作信息儲存之用,畢竟,DNA對生物的作用本質(zhì)上來說就是保存信息。就這一點來說,基因即是信息,DNA 則是極其穩(wěn)定的數(shù)據(jù)格式。

未來,久經(jīng)測試的基因模塊可以由專業(yè)人士甚至非專業(yè)人員組合在一起,生產(chǎn)不同的生物工程產(chǎn)品。人們可以從一個干細胞中培育出新的有機體,可以在幾個星期內(nèi)破解任何現(xiàn)存有機體的基因組序列,包括表觀遺傳指令編碼。在合成生物技術(shù)下,人們有潛力重新創(chuàng)造這個星球上的任何生物體。

對于瀕臨滅絕的動物群,人們也有了更好、更有力的保護措施。2008年,人類完成了長毛猛犸象的基因測序,據(jù)說日本研究者用現(xiàn)存的有親緣關(guān)系的大象作為代孕母親來克隆它們。利用合成生物學(xué)復(fù)活滅絕物種極有可能成功,因為任何丟失的基因信息都可以用“即插即用”的基因模塊替代。

一條并不普通的領(lǐng)帶

出乎人們意料的是,合成生物學(xué)的里程碑是一條并不普通的領(lǐng)帶。

蜘蛛絲領(lǐng)帶是外螺紋(Bolt Threads)生物科技公司的第一項商品,也是生物技術(shù)發(fā)展的一個里程碑,雖然未能實現(xiàn)商業(yè)化,但也卻給人們帶來了足夠多的震撼。畢竟,這條領(lǐng)帶是以蜘蛛絲織成,這也解釋了它的定價為什么如此昂貴。

要知道,蜘蛛絲是一種出色的材料,不同品種的蜘蛛在不同的情況下可以分泌出結(jié)構(gòu)各異的絲蛋白,用來結(jié)網(wǎng)、包裹獵物或保護卵囊。每一種蜘蛛絲靭性和延展性都不是人類能夠簡單復(fù)制的。就承重性來說,蜘蛛的絲線比鋼鐵更強韌。

位于蜘蛛腹部的紡絲器像一個構(gòu)造復(fù)雜的內(nèi)嵌式水龍頭,會依照所需蛛網(wǎng)類型重新排列絲蛋白分子,而噴出的蛛絲會從液態(tài)變成固態(tài)。雖然人類非常想要采集蜘蛛絲,但蜘蛛?yún)s是出了名的難養(yǎng)。多數(shù)蜘蛛都沒有群居的習(xí)慣,并且還會同類相食,種種習(xí)性都不利于產(chǎn)業(yè)化養(yǎng)殖,因此,想收集足量的蛛絲纖維來制造產(chǎn)品可以說是極其困難。然而,外螺紋生物科技公司卻利用酵母合成了與蜘蛛絲幾乎無差的“蜘蛛絲”。其背后,正是合成生物技術(shù)。

實際上,一直以來,人類都在設(shè)計如何讓動植物產(chǎn)出原料,供己所用。然而養(yǎng)殖技術(shù)終須受限于有性生殖漫長又繁瑣的過程。并且這樣的繁殖只能存在于同類物種之間。現(xiàn)在,有了合成生物科技,就可以打破這些限制,把位于演化樹不同分支上,甚至相隔億萬年的物種兩相結(jié)合,比如蜘蛛與酵母。合成生物學(xué)的工作就是提取出生物的原始碼,將其重新設(shè)計成效率更高的生物工廠。

合成生物學(xué)不僅能成功跨界到服裝業(yè),在服裝業(yè)之外,醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、藥品、能源,以至探索宇宙的方式都正在等待合成生物技術(shù)的開發(fā)。

對于醫(yī)學(xué)而言,合成生物技術(shù)也是一種全新的推動力??焖倏煽康睾铣啥嗖考到y(tǒng),使之走出實驗室并成為一種可用于交易的標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)品,這是現(xiàn)代技術(shù)能力的標(biāo)志。這種科學(xué)背后的愿景是,這些生物部件可以連接在一起,創(chuàng)造出細胞、組織或生物系統(tǒng),以可預(yù)期的方式可靠地執(zhí)行特定的任務(wù)。合成生物學(xué)家最終希望能夠?qū)毎?、細胞系統(tǒng)或組織進行編程,以執(zhí)行特定的任務(wù)和功能。

而如果我們可以設(shè)計和生產(chǎn)人工細胞,那就意味著新的醫(yī)學(xué)時代已經(jīng)不遠了。人工細胞、器官和骨骼以及合成的DNA將被用于再生人類,從而擊敗衰老,催生長壽市場,這對人類具有巨大價值。

在醫(yī)學(xué)的新未來中,一個完整的醫(yī)療供應(yīng)鏈被創(chuàng)建出來,致力于長壽、再生、人類健康和人類物種的醫(yī)療增強。正如我預(yù)測的那樣,這將導(dǎo)致一個新文明的出現(xiàn),不僅會消除大多數(shù)疾病,而且會從醫(yī)療上完全改變?nèi)祟惖倪M化,使人類能夠活得更久、更健康、更聰明。

迷人的危險

當(dāng)然,合成生物學(xué)的未來并不限于地球。比如,美國太空總署(NASA)就投入了大量人力物力發(fā)展合成生物技術(shù)。

畢竟,當(dāng)航天員抵達其他星球,就會需要氧氣、食物和安全的住所。通過合成生物技術(shù),航天員就可以運用標(biāo)準(zhǔn)化的生物元件制造細胞,來生成氧氣,甚至磚塊。這些細胞會分泌帶黏性的分子植入模仿火星風(fēng)化層的沙土后,將凝固成磚塊。這項技術(shù)需要一整個試管的細胞、一點水和火星上的沙子,而其中只有一種原料需要從地球帶過去。

當(dāng)然,長期下來,真正能落實的合成生物還是太少。畢竟,理想中的合成生物成為現(xiàn)實,表現(xiàn)未必合乎預(yù)期。就像研發(fā)中的電子產(chǎn)品,按設(shè)計原本該出現(xiàn)清晰的數(shù)據(jù)輸出,卻常被系統(tǒng)噪聲擾亂。生物傳感器也好,藥物或者是燃料也好,當(dāng)前,依然有許多輸出都受到阻撓。人們依然需要更沉著、務(wù)實的計劃來發(fā)展合成生物技術(shù)。

另一個需要擔(dān)憂的問題是,盡管合成生物學(xué)目前監(jiān)管嚴(yán)格,用的是類似于監(jiān)管轉(zhuǎn)基因生物的策略,但是當(dāng)合成生物產(chǎn)品涌入自然界,人們又該如何控制?在分子的層面人們能控制得很好,并不代表從個體和生態(tài)層面也能做到萬無一失。

比如,人類確實可以將基因或者基因組的順序打亂,來創(chuàng)造大自然還沒來得及創(chuàng)造的東西,但是生物學(xué)單元不會孤立地存在?;?、蛋白質(zhì)復(fù)合物以及細胞模塊組成的單元復(fù)合體,它們總是在個體內(nèi)部不斷進化,以應(yīng)對多變的環(huán)境。

模塊可以循環(huán)交換,從而使系統(tǒng)具有可塑性。當(dāng)然,這種可塑性必須遵守一定的規(guī)則,合成生物學(xué)正是構(gòu)建在這些規(guī)則之上。人類真的已經(jīng)對分子原則了如指掌,從而敢于將合成生物放歸自然生態(tài)系統(tǒng)了嗎?事實是,即使在實驗室條件下,當(dāng)然,人們對控制典型生物細胞分化的表觀遺傳過程還所知寥寥。

合成生物技術(shù)必然推動生態(tài)系統(tǒng)改變著它們的形式、功能和關(guān)系。我們可以在實驗室中創(chuàng)造出看上去完美無瑕,表現(xiàn)也無可挑剔的生物單元,但是人類不能控制生態(tài)和進化將如何把合成生物單元重新連接到生態(tài)系統(tǒng)中,同樣我們也不能預(yù)測合成單元會如何重新聯(lián)系生態(tài)系統(tǒng)和它的棲居者。

“創(chuàng)造自然”當(dāng)然是迷人的,但也是危險的。人類真的能在創(chuàng)造出的生物體上安裝一個“停止進化”的開關(guān)嗎?又該如何確定合成生物的可控?當(dāng)工程化模塊毀壞,或者它們轉(zhuǎn)移到其他生物體上,又會導(dǎo)致什么樣的結(jié)果?這些對于目前來說,都是不可想象的,但卻是人們必然要面對的未來。

本文為轉(zhuǎn)載內(nèi)容,授權(quán)事宜請聯(lián)系原著作權(quán)人。

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從基因模塊到合成生物,創(chuàng)造“自然”的迷人和危險

把拼接大自然的“原始積木”拆開,然后以更適合人們需要的方式重新搭建起來的合成生物技術(shù),既迷人,又危險。

文|觀察未來科技

過去,人們一直在想象著怎樣改善社會和環(huán)境,現(xiàn)在,在合成生物學(xué)的支持下,人們正在實現(xiàn)這些夢想。合成生物學(xué)是一項關(guān)于創(chuàng)造自然的神奇技術(shù)——人們需要先把拼接大自然的“原始積木”拆開,然后以更適合人們需要的方式重新搭建起來。制造生物燃料、幫助改善干細胞生物學(xué),這些都是合成生物學(xué)。

如今,人們已經(jīng)可以用酸奶肅清霍亂,可以生產(chǎn)酵母來給汽車提供動力,還可以改變微生物基因來清理環(huán)境。在未來,人們甚至還能用現(xiàn)有的生物實現(xiàn)電子工程干的事情——生物計算機將與普通計算機一樣實現(xiàn)邏輯門運算,這無疑為生物學(xué)開辟了新的道路。

從基因模塊到合成生物

合成生物學(xué)是一個新興領(lǐng)域,它主要是運用工程技術(shù)來設(shè)計和構(gòu)建新的生物部件、設(shè)備和系統(tǒng),以實現(xiàn)自然界中不存在的新穎功能或生命形式。合成生物學(xué)依賴基因工程、生物工程、系統(tǒng)生物學(xué)和許多其他工程學(xué)科,并且需要使用這些學(xué)科所提供的工具。

實際上,人們很早就已經(jīng)在嘗試改造“生物”以創(chuàng)新自然。早在12000年前農(nóng)業(yè)開始出現(xiàn)的時候,人們就一直用馴化馴養(yǎng),進而用育種和人工選擇的方法改良動植物。人類誘捕酵母和細菌來制作啤酒、葡萄酒和奶酪;馴服動物,使動物能夠成為人類最好的朋友;人們還巧妙地把草原變成食物來源。

人們改造“生物”的進一步發(fā)展,就誕生了合成生物學(xué)這門技術(shù)。合成生物學(xué)的誕生,還離不開一個重要的背景,就是人類對于基因的認(rèn)識。

我們可以將基因看作是大自然的原始碼。幾十年前,人類逐漸學(xué)會了能又快又精準(zhǔn)地萃取基因、描述其特性,并開始思索如何將基因植回生物體內(nèi)——有時植人相同物種,有時植入完全不同的物種。研究人員可能會保持基因完好,以觀察其表現(xiàn);或是予以修改,甚至蓄意破壞,來觀察這些部分受損的基因會發(fā)生什么事,并基于此來測試不同基因的作用。這就是所謂的基因工程。

基因工程技術(shù)之所以能成真,在于所有生物的基本組成單位都是一樣的。地球上所有生物都由四個“字母”排列組合而成,這些字母組成有意義的DNA,編寫出基因,再轉(zhuǎn)譯成22種胺基酸;這些胺基酸互相鏈結(jié),形成了蛋白質(zhì)——蛋白質(zhì)則是構(gòu)成生命體的主要成分。

在基因工程的背景下,一個“即插即用”的方法正在被開發(fā)出來,以便于分子水平上的操作,那就是合成生物技術(shù)。通過合成生物學(xué),人類得以建立了一套系統(tǒng),截取這些經(jīng)過千萬年演化的基因并進行重新組合。

合成生物學(xué)有多種類型。一些研究者不僅為特定目的而重新編寫基因碼,更以這些“字母”重新編寫出自然界沒有的DNA“語言”。另一些科學(xué)家則著眼于將DNA作信息儲存之用,畢竟,DNA對生物的作用本質(zhì)上來說就是保存信息。就這一點來說,基因即是信息,DNA 則是極其穩(wěn)定的數(shù)據(jù)格式。

未來,久經(jīng)測試的基因模塊可以由專業(yè)人士甚至非專業(yè)人員組合在一起,生產(chǎn)不同的生物工程產(chǎn)品。人們可以從一個干細胞中培育出新的有機體,可以在幾個星期內(nèi)破解任何現(xiàn)存有機體的基因組序列,包括表觀遺傳指令編碼。在合成生物技術(shù)下,人們有潛力重新創(chuàng)造這個星球上的任何生物體。

對于瀕臨滅絕的動物群,人們也有了更好、更有力的保護措施。2008年,人類完成了長毛猛犸象的基因測序,據(jù)說日本研究者用現(xiàn)存的有親緣關(guān)系的大象作為代孕母親來克隆它們。利用合成生物學(xué)復(fù)活滅絕物種極有可能成功,因為任何丟失的基因信息都可以用“即插即用”的基因模塊替代。

一條并不普通的領(lǐng)帶

出乎人們意料的是,合成生物學(xué)的里程碑是一條并不普通的領(lǐng)帶。

蜘蛛絲領(lǐng)帶是外螺紋(Bolt Threads)生物科技公司的第一項商品,也是生物技術(shù)發(fā)展的一個里程碑,雖然未能實現(xiàn)商業(yè)化,但也卻給人們帶來了足夠多的震撼。畢竟,這條領(lǐng)帶是以蜘蛛絲織成,這也解釋了它的定價為什么如此昂貴。

要知道,蜘蛛絲是一種出色的材料,不同品種的蜘蛛在不同的情況下可以分泌出結(jié)構(gòu)各異的絲蛋白,用來結(jié)網(wǎng)、包裹獵物或保護卵囊。每一種蜘蛛絲靭性和延展性都不是人類能夠簡單復(fù)制的。就承重性來說,蜘蛛的絲線比鋼鐵更強韌。

位于蜘蛛腹部的紡絲器像一個構(gòu)造復(fù)雜的內(nèi)嵌式水龍頭,會依照所需蛛網(wǎng)類型重新排列絲蛋白分子,而噴出的蛛絲會從液態(tài)變成固態(tài)。雖然人類非常想要采集蜘蛛絲,但蜘蛛?yún)s是出了名的難養(yǎng)。多數(shù)蜘蛛都沒有群居的習(xí)慣,并且還會同類相食,種種習(xí)性都不利于產(chǎn)業(yè)化養(yǎng)殖,因此,想收集足量的蛛絲纖維來制造產(chǎn)品可以說是極其困難。然而,外螺紋生物科技公司卻利用酵母合成了與蜘蛛絲幾乎無差的“蜘蛛絲”。其背后,正是合成生物技術(shù)。

實際上,一直以來,人類都在設(shè)計如何讓動植物產(chǎn)出原料,供己所用。然而養(yǎng)殖技術(shù)終須受限于有性生殖漫長又繁瑣的過程。并且這樣的繁殖只能存在于同類物種之間?,F(xiàn)在,有了合成生物科技,就可以打破這些限制,把位于演化樹不同分支上,甚至相隔億萬年的物種兩相結(jié)合,比如蜘蛛與酵母。合成生物學(xué)的工作就是提取出生物的原始碼,將其重新設(shè)計成效率更高的生物工廠。

合成生物學(xué)不僅能成功跨界到服裝業(yè),在服裝業(yè)之外,醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)、藥品、能源,以至探索宇宙的方式都正在等待合成生物技術(shù)的開發(fā)。

對于醫(yī)學(xué)而言,合成生物技術(shù)也是一種全新的推動力??焖倏煽康睾铣啥嗖考到y(tǒng),使之走出實驗室并成為一種可用于交易的標(biāo)準(zhǔn)化產(chǎn)品,這是現(xiàn)代技術(shù)能力的標(biāo)志。這種科學(xué)背后的愿景是,這些生物部件可以連接在一起,創(chuàng)造出細胞、組織或生物系統(tǒng),以可預(yù)期的方式可靠地執(zhí)行特定的任務(wù)。合成生物學(xué)家最終希望能夠?qū)毎⒓毎到y(tǒng)或組織進行編程,以執(zhí)行特定的任務(wù)和功能。

而如果我們可以設(shè)計和生產(chǎn)人工細胞,那就意味著新的醫(yī)學(xué)時代已經(jīng)不遠了。人工細胞、器官和骨骼以及合成的DNA將被用于再生人類,從而擊敗衰老,催生長壽市場,這對人類具有巨大價值。

在醫(yī)學(xué)的新未來中,一個完整的醫(yī)療供應(yīng)鏈被創(chuàng)建出來,致力于長壽、再生、人類健康和人類物種的醫(yī)療增強。正如我預(yù)測的那樣,這將導(dǎo)致一個新文明的出現(xiàn),不僅會消除大多數(shù)疾病,而且會從醫(yī)療上完全改變?nèi)祟惖倪M化,使人類能夠活得更久、更健康、更聰明。

迷人的危險

當(dāng)然,合成生物學(xué)的未來并不限于地球。比如,美國太空總署(NASA)就投入了大量人力物力發(fā)展合成生物技術(shù)。

畢竟,當(dāng)航天員抵達其他星球,就會需要氧氣、食物和安全的住所。通過合成生物技術(shù),航天員就可以運用標(biāo)準(zhǔn)化的生物元件制造細胞,來生成氧氣,甚至磚塊。這些細胞會分泌帶黏性的分子植入模仿火星風(fēng)化層的沙土后,將凝固成磚塊。這項技術(shù)需要一整個試管的細胞、一點水和火星上的沙子,而其中只有一種原料需要從地球帶過去。

當(dāng)然,長期下來,真正能落實的合成生物還是太少。畢竟,理想中的合成生物成為現(xiàn)實,表現(xiàn)未必合乎預(yù)期。就像研發(fā)中的電子產(chǎn)品,按設(shè)計原本該出現(xiàn)清晰的數(shù)據(jù)輸出,卻常被系統(tǒng)噪聲擾亂。生物傳感器也好,藥物或者是燃料也好,當(dāng)前,依然有許多輸出都受到阻撓。人們依然需要更沉著、務(wù)實的計劃來發(fā)展合成生物技術(shù)。

另一個需要擔(dān)憂的問題是,盡管合成生物學(xué)目前監(jiān)管嚴(yán)格,用的是類似于監(jiān)管轉(zhuǎn)基因生物的策略,但是當(dāng)合成生物產(chǎn)品涌入自然界,人們又該如何控制?在分子的層面人們能控制得很好,并不代表從個體和生態(tài)層面也能做到萬無一失。

比如,人類確實可以將基因或者基因組的順序打亂,來創(chuàng)造大自然還沒來得及創(chuàng)造的東西,但是生物學(xué)單元不會孤立地存在?;?、蛋白質(zhì)復(fù)合物以及細胞模塊組成的單元復(fù)合體,它們總是在個體內(nèi)部不斷進化,以應(yīng)對多變的環(huán)境。

模塊可以循環(huán)交換,從而使系統(tǒng)具有可塑性。當(dāng)然,這種可塑性必須遵守一定的規(guī)則,合成生物學(xué)正是構(gòu)建在這些規(guī)則之上。人類真的已經(jīng)對分子原則了如指掌,從而敢于將合成生物放歸自然生態(tài)系統(tǒng)了嗎?事實是,即使在實驗室條件下,當(dāng)然,人們對控制典型生物細胞分化的表觀遺傳過程還所知寥寥。

合成生物技術(shù)必然推動生態(tài)系統(tǒng)改變著它們的形式、功能和關(guān)系。我們可以在實驗室中創(chuàng)造出看上去完美無瑕,表現(xiàn)也無可挑剔的生物單元,但是人類不能控制生態(tài)和進化將如何把合成生物單元重新連接到生態(tài)系統(tǒng)中,同樣我們也不能預(yù)測合成單元會如何重新聯(lián)系生態(tài)系統(tǒng)和它的棲居者。

“創(chuàng)造自然”當(dāng)然是迷人的,但也是危險的。人類真的能在創(chuàng)造出的生物體上安裝一個“停止進化”的開關(guān)嗎?又該如何確定合成生物的可控?當(dāng)工程化模塊毀壞,或者它們轉(zhuǎn)移到其他生物體上,又會導(dǎo)致什么樣的結(jié)果?這些對于目前來說,都是不可想象的,但卻是人們必然要面對的未來。

本文為轉(zhuǎn)載內(nèi)容,授權(quán)事宜請聯(lián)系原著作權(quán)人。