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環(huán)狀RNA五十年:從“棄子”到風(fēng)口

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環(huán)狀RNA五十年:從“棄子”到風(fēng)口

環(huán)狀RNA賽道,或許開始起風(fēng)了。

文|氨基財(cái)經(jīng)

新冠疫苗競賽,讓mRNA技術(shù)正式走上臺前,也快速成為產(chǎn)業(yè)和資本熱點(diǎn)。

因?yàn)樽屓梭@嘆的mRNA技術(shù),前景絕不僅限于預(yù)防性疫苗。還包括治療性疫苗和免疫療法。

目前,各大藥企關(guān)于mRNA技術(shù)的研究如火如荼,或許不久的將來就會給我們帶來更多驚喜。

但是,mRNA并不完美,因?yàn)槠浞€(wěn)定不高等諸多缺點(diǎn)會導(dǎo)致天花板受限。在這一背景下,挑戰(zhàn)者環(huán)狀RNA賽道開始逐漸升溫。

因此與mRNA相比,環(huán)狀RNA理論上具備穩(wěn)定性更高、表達(dá)時(shí)間更長、生產(chǎn)成本較低等優(yōu)勢,有望解決線形mRNA面對的多種挑戰(zhàn)。

8月16日,默沙東宣布與Orna公司達(dá)成一項(xiàng)總額高達(dá)36.5億美元的合作協(xié)議,雙方將基于Orna公司的環(huán)狀RNA平臺,開發(fā)包括傳染病和腫瘤學(xué)領(lǐng)域的疫苗和療法,為環(huán)狀RNA賽道添了一把火。

環(huán)狀RNA賽道,或許開始起風(fēng)了。

從“垃圾”到研究熱門,一切因高通量測序而改變

環(huán)狀RNA(circRNA)的特殊之處在于其結(jié)構(gòu)。與以 5' 帽和 3' 尾終止的線性 RNA 不同,環(huán)狀RNA形成的是共價(jià)閉環(huán)結(jié)構(gòu)。

實(shí)際上,環(huán)狀RNA早在上世紀(jì)70年代就被人們發(fā)現(xiàn)。只不過,它最初被認(rèn)為是基因剪切的副產(chǎn)物,并無顯著功能,所以被忽視了。

不過,2010年之后,隨著高通量測序技術(shù)的進(jìn)步,環(huán)狀RNA的結(jié)構(gòu)和功能開始為人所知。

目前,醫(yī)學(xué)界已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)circRNA。大量的細(xì)胞研究表明,環(huán)狀RNA通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄、剪接、mRNA穩(wěn)定性、翻譯和信號通路、以及作為翻譯模板來調(diào)節(jié)基因表達(dá),功能遠(yuǎn)超線性mRNA。

因?yàn)楸姸鄼C(jī)制導(dǎo)致,環(huán)狀RNA還參與了人體多種病理狀況的發(fā)展,例如心血管疾病、糖尿病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病,包括癌癥。

一些研究發(fā)現(xiàn),許多環(huán)狀RNA與腫瘤病理學(xué)過程中的細(xì)胞周期有關(guān)。并且,在多種癌癥中觀察到許多環(huán)狀RNA的異常表達(dá),表明它們在腫瘤發(fā)生和腫瘤發(fā)展中的關(guān)鍵作用。

例如,在胃癌中,環(huán)狀RNA之一的circPVRL3表達(dá)水平的降低,會加速胃癌的進(jìn)展和導(dǎo)致更低的生存率。

當(dāng)然,也有些環(huán)狀RNA會促進(jìn)腫瘤的發(fā)生。例如,在肝癌領(lǐng)域我們發(fā)現(xiàn),另一環(huán)狀RNAciRS-7可能作為miR-7的ceRNA,競爭性地抑制miR-7的活性,促進(jìn)癌基因的表達(dá)。

這一發(fā)現(xiàn),也讓我們有了對抗腫瘤的新型武器。畢竟,ciRS-7或許是癌癥早期診斷和治療的靶點(diǎn)。

正是環(huán)狀RNA的功能與特性不斷被發(fā)現(xiàn),其前景也愈發(fā)“光明”。

既可以是臨床診斷標(biāo)志物,也可以是治療手段

目前來看,環(huán)狀RNA不僅有望成為臨床診斷、治療和預(yù)后的生物標(biāo)志物,也可以靶向治療的潛在靶點(diǎn)。

僅作為生物標(biāo)志物,環(huán)狀RNA前途便不可限量。因?yàn)?,環(huán)狀RNA具有諸多特點(diǎn),導(dǎo)致其非常適合作為一種生物標(biāo)志物。

特點(diǎn)可以總結(jié)為“保守的序列、組織特異性、高穩(wěn)定性和高豐度”

首先,是高豐度。雖然環(huán)狀RNA通常具有低表達(dá)水平,但在某些情況下,由于更高的表達(dá)或時(shí)間積累,它們的豐度可能超過同源線性mRNAs的豐度,更容易檢測。

其次,是高特異性。環(huán)狀RNA高度特異性,在不同細(xì)胞和組織類型以及發(fā)育階段的表達(dá)模式非常多樣化,辨識度較高。

另外,高保守性。環(huán)狀RNA最大的特點(diǎn)就是高度保守,有研究發(fā)現(xiàn)小鼠和人類中的直系同源基因,依然有5-30%相似的保守環(huán)狀RNA。高保守的序列,也導(dǎo)致其更容易被“針對”。

最后,則是高穩(wěn)定性。環(huán)狀RNA由于其結(jié)構(gòu)特殊性,可以抵抗線性mRNA衰減機(jī)制的降解,半衰期為18.8-23.7h(其同源線性mRNA為4.0-7.4h),這讓其同容易在包括唾液、和血液等體液中被檢測發(fā)現(xiàn)。實(shí)際上,環(huán)狀RNA的穩(wěn)定性大大提高,這是其被視為前景超過mRNA的核心原因。

若能充分利用上述幾個(gè)特點(diǎn),環(huán)狀RNA或許可以成為我們診斷疾病的重要手段。

例如,在肝癌中,環(huán)狀RNA之一的Hsa_circ_0001649 便會顯著下調(diào)。這表明它可能作為一種新的潛在肝癌生物標(biāo)志物,根據(jù)其表達(dá)水平來判斷腫瘤大小的變化情況。當(dāng)然,不僅是腫瘤,包括阿爾茲海默癥等,環(huán)狀RNA都是潛在的生物標(biāo)志物。

實(shí)際上,基于特異性、保守性等特點(diǎn),環(huán)狀RNA不僅是生物標(biāo)志物的潛力選手,更有希望成為絕佳治療靶點(diǎn)。

正如上文所說,RNAciRS-7可能作為miR-7的ceRNA,競爭性地抑制miR-7的活性,促進(jìn)癌基因的表達(dá)。ciRS-7理論上,也是我們治療肝癌的靶點(diǎn)之一。

盡管目前還沒有任何使用 circRNA 作為癌癥治療靶點(diǎn)的臨床前報(bào)告,但這種情況在不久的將來,可能會發(fā)生變化。

成為下一個(gè)風(fēng)口背后,風(fēng)險(xiǎn)與機(jī)遇共存

當(dāng)然,凡事都要客觀來看。雖然環(huán)狀RNA前景看似不錯(cuò),但其終究還只是一個(gè)非常年輕的技術(shù)。正如上文所說,我們對環(huán)狀RNA認(rèn)識的提升,主要就是在近十年時(shí)間。

這也導(dǎo)致整個(gè)領(lǐng)域要想真正突破還有待時(shí)日。因?yàn)?,僅近十年時(shí)間,我們對其認(rèn)識并不深刻。目前,環(huán)狀RNA還有許多謎團(tuán),無論是其精確的形成機(jī)制,還是運(yùn)輸和成熟過程,都在等待答案。

例如,據(jù)觀察,大多數(shù)環(huán)狀RNA在細(xì)胞質(zhì)中巡邏,但它們起源于細(xì)胞核,因此提出了它們?nèi)绾未┻^微小核孔的問題。

此外,許多環(huán)狀外顯子(85%)與蛋白質(zhì)編碼序列重疊,但大多數(shù)環(huán)狀RNA不編碼蛋白質(zhì)這一事實(shí)仍有待研究。在臨床上,它們需要進(jìn)一步測試,才能完全取代傳統(tǒng)的診斷程序。

當(dāng)然,醫(yī)學(xué)界對其研究也在不斷向前,成果也會持續(xù)落地。

例如,oRNA公司便希望利用環(huán)狀RNA更為穩(wěn)定等特點(diǎn),超越mRNA技術(shù)。目前,oRNA公司開發(fā)的基于環(huán)狀RNA的CD19 CAR-T療法已經(jīng)進(jìn)入臨床階段。

由于該療法直接體內(nèi)產(chǎn)生經(jīng)過修飾的免疫細(xì)胞,若臨床成功無疑有望克服現(xiàn)有體外CAR-T 療法的障礙。

國內(nèi)企業(yè)也在前進(jìn)。目前,以環(huán)碼生物、圓因生物、吉賽生物、科銳邁德為代表的環(huán)狀RNA新銳,紛紛打造了環(huán)狀RNA技術(shù)平臺,與海外企業(yè)齊頭并進(jìn)。

或許在不遠(yuǎn)的將來,他們也會帶來好消息。

本文為轉(zhuǎn)載內(nèi)容,授權(quán)事宜請聯(lián)系原著作權(quán)人。

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環(huán)狀RNA五十年:從“棄子”到風(fēng)口

環(huán)狀RNA賽道,或許開始起風(fēng)了。

文|氨基財(cái)經(jīng)

新冠疫苗競賽,讓mRNA技術(shù)正式走上臺前,也快速成為產(chǎn)業(yè)和資本熱點(diǎn)。

因?yàn)樽屓梭@嘆的mRNA技術(shù),前景絕不僅限于預(yù)防性疫苗。還包括治療性疫苗和免疫療法。

目前,各大藥企關(guān)于mRNA技術(shù)的研究如火如荼,或許不久的將來就會給我們帶來更多驚喜。

但是,mRNA并不完美,因?yàn)槠浞€(wěn)定不高等諸多缺點(diǎn)會導(dǎo)致天花板受限。在這一背景下,挑戰(zhàn)者環(huán)狀RNA賽道開始逐漸升溫。

因此與mRNA相比,環(huán)狀RNA理論上具備穩(wěn)定性更高、表達(dá)時(shí)間更長、生產(chǎn)成本較低等優(yōu)勢,有望解決線形mRNA面對的多種挑戰(zhàn)。

8月16日,默沙東宣布與Orna公司達(dá)成一項(xiàng)總額高達(dá)36.5億美元的合作協(xié)議,雙方將基于Orna公司的環(huán)狀RNA平臺,開發(fā)包括傳染病和腫瘤學(xué)領(lǐng)域的疫苗和療法,為環(huán)狀RNA賽道添了一把火。

環(huán)狀RNA賽道,或許開始起風(fēng)了。

從“垃圾”到研究熱門,一切因高通量測序而改變

環(huán)狀RNA(circRNA)的特殊之處在于其結(jié)構(gòu)。與以 5' 帽和 3' 尾終止的線性 RNA 不同,環(huán)狀RNA形成的是共價(jià)閉環(huán)結(jié)構(gòu)。

實(shí)際上,環(huán)狀RNA早在上世紀(jì)70年代就被人們發(fā)現(xiàn)。只不過,它最初被認(rèn)為是基因剪切的副產(chǎn)物,并無顯著功能,所以被忽視了。

不過,2010年之后,隨著高通量測序技術(shù)的進(jìn)步,環(huán)狀RNA的結(jié)構(gòu)和功能開始為人所知。

目前,醫(yī)學(xué)界已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)circRNA。大量的細(xì)胞研究表明,環(huán)狀RNA通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄、剪接、mRNA穩(wěn)定性、翻譯和信號通路、以及作為翻譯模板來調(diào)節(jié)基因表達(dá),功能遠(yuǎn)超線性mRNA。

因?yàn)楸姸鄼C(jī)制導(dǎo)致,環(huán)狀RNA還參與了人體多種病理狀況的發(fā)展,例如心血管疾病、糖尿病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病,包括癌癥。

一些研究發(fā)現(xiàn),許多環(huán)狀RNA與腫瘤病理學(xué)過程中的細(xì)胞周期有關(guān)。并且,在多種癌癥中觀察到許多環(huán)狀RNA的異常表達(dá),表明它們在腫瘤發(fā)生和腫瘤發(fā)展中的關(guān)鍵作用。

例如,在胃癌中,環(huán)狀RNA之一的circPVRL3表達(dá)水平的降低,會加速胃癌的進(jìn)展和導(dǎo)致更低的生存率。

當(dāng)然,也有些環(huán)狀RNA會促進(jìn)腫瘤的發(fā)生。例如,在肝癌領(lǐng)域我們發(fā)現(xiàn),另一環(huán)狀RNAciRS-7可能作為miR-7的ceRNA,競爭性地抑制miR-7的活性,促進(jìn)癌基因的表達(dá)。

這一發(fā)現(xiàn),也讓我們有了對抗腫瘤的新型武器。畢竟,ciRS-7或許是癌癥早期診斷和治療的靶點(diǎn)。

正是環(huán)狀RNA的功能與特性不斷被發(fā)現(xiàn),其前景也愈發(fā)“光明”。

既可以是臨床診斷標(biāo)志物,也可以是治療手段

目前來看,環(huán)狀RNA不僅有望成為臨床診斷、治療和預(yù)后的生物標(biāo)志物,也可以靶向治療的潛在靶點(diǎn)。

僅作為生物標(biāo)志物,環(huán)狀RNA前途便不可限量。因?yàn)?,環(huán)狀RNA具有諸多特點(diǎn),導(dǎo)致其非常適合作為一種生物標(biāo)志物。

特點(diǎn)可以總結(jié)為“保守的序列、組織特異性、高穩(wěn)定性和高豐度”

首先,是高豐度。雖然環(huán)狀RNA通常具有低表達(dá)水平,但在某些情況下,由于更高的表達(dá)或時(shí)間積累,它們的豐度可能超過同源線性mRNAs的豐度,更容易檢測。

其次,是高特異性。環(huán)狀RNA高度特異性,在不同細(xì)胞和組織類型以及發(fā)育階段的表達(dá)模式非常多樣化,辨識度較高。

另外,高保守性。環(huán)狀RNA最大的特點(diǎn)就是高度保守,有研究發(fā)現(xiàn)小鼠和人類中的直系同源基因,依然有5-30%相似的保守環(huán)狀RNA。高保守的序列,也導(dǎo)致其更容易被“針對”。

最后,則是高穩(wěn)定性。環(huán)狀RNA由于其結(jié)構(gòu)特殊性,可以抵抗線性mRNA衰減機(jī)制的降解,半衰期為18.8-23.7h(其同源線性mRNA為4.0-7.4h),這讓其同容易在包括唾液、和血液等體液中被檢測發(fā)現(xiàn)。實(shí)際上,環(huán)狀RNA的穩(wěn)定性大大提高,這是其被視為前景超過mRNA的核心原因。

若能充分利用上述幾個(gè)特點(diǎn),環(huán)狀RNA或許可以成為我們診斷疾病的重要手段。

例如,在肝癌中,環(huán)狀RNA之一的Hsa_circ_0001649 便會顯著下調(diào)。這表明它可能作為一種新的潛在肝癌生物標(biāo)志物,根據(jù)其表達(dá)水平來判斷腫瘤大小的變化情況。當(dāng)然,不僅是腫瘤,包括阿爾茲海默癥等,環(huán)狀RNA都是潛在的生物標(biāo)志物。

實(shí)際上,基于特異性、保守性等特點(diǎn),環(huán)狀RNA不僅是生物標(biāo)志物的潛力選手,更有希望成為絕佳治療靶點(diǎn)。

正如上文所說,RNAciRS-7可能作為miR-7的ceRNA,競爭性地抑制miR-7的活性,促進(jìn)癌基因的表達(dá)。ciRS-7理論上,也是我們治療肝癌的靶點(diǎn)之一。

盡管目前還沒有任何使用 circRNA 作為癌癥治療靶點(diǎn)的臨床前報(bào)告,但這種情況在不久的將來,可能會發(fā)生變化。

成為下一個(gè)風(fēng)口背后,風(fēng)險(xiǎn)與機(jī)遇共存

當(dāng)然,凡事都要客觀來看。雖然環(huán)狀RNA前景看似不錯(cuò),但其終究還只是一個(gè)非常年輕的技術(shù)。正如上文所說,我們對環(huán)狀RNA認(rèn)識的提升,主要就是在近十年時(shí)間。

這也導(dǎo)致整個(gè)領(lǐng)域要想真正突破還有待時(shí)日。因?yàn)?,僅近十年時(shí)間,我們對其認(rèn)識并不深刻。目前,環(huán)狀RNA還有許多謎團(tuán),無論是其精確的形成機(jī)制,還是運(yùn)輸和成熟過程,都在等待答案。

例如,據(jù)觀察,大多數(shù)環(huán)狀RNA在細(xì)胞質(zhì)中巡邏,但它們起源于細(xì)胞核,因此提出了它們?nèi)绾未┻^微小核孔的問題。

此外,許多環(huán)狀外顯子(85%)與蛋白質(zhì)編碼序列重疊,但大多數(shù)環(huán)狀RNA不編碼蛋白質(zhì)這一事實(shí)仍有待研究。在臨床上,它們需要進(jìn)一步測試,才能完全取代傳統(tǒng)的診斷程序。

當(dāng)然,醫(yī)學(xué)界對其研究也在不斷向前,成果也會持續(xù)落地。

例如,oRNA公司便希望利用環(huán)狀RNA更為穩(wěn)定等特點(diǎn),超越mRNA技術(shù)。目前,oRNA公司開發(fā)的基于環(huán)狀RNA的CD19 CAR-T療法已經(jīng)進(jìn)入臨床階段。

由于該療法直接體內(nèi)產(chǎn)生經(jīng)過修飾的免疫細(xì)胞,若臨床成功無疑有望克服現(xiàn)有體外CAR-T 療法的障礙。

國內(nèi)企業(yè)也在前進(jìn)。目前,以環(huán)碼生物、圓因生物、吉賽生物、科銳邁德為代表的環(huán)狀RNA新銳,紛紛打造了環(huán)狀RNA技術(shù)平臺,與海外企業(yè)齊頭并進(jìn)。

或許在不遠(yuǎn)的將來,他們也會帶來好消息。

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